GenoCare病原微生物宏基因組測序試劑盒
GenoCare病原微生物宏基因組測序試劑盒

GenoCare病原微生物檢測,是基于宏基因組單分子測序技術快速對病原微生物進行檢測的新產品。通過采集病原微生物樣本,提取DNA并構建文庫,在真邁生物GenoCare 1600單分子測序平臺上進行測序,然后通過微生物專用數據庫比對和智能化算法分析,獲得疑似致病微生物的種屬信息,并出具全面深入的報告,這為疑難危重特殊感染的病原體檢測等應用提供了一種新方法和新平臺。

產品簡介

GenoCare病原微生物檢測,是基于宏基因組單分子測序技術快速對病原微生物進行檢測的新產品。通過采集病原微生物樣本,提取DNA并構建文庫,在真邁生物GenoCare 1600單分子測序平臺上進行測序,然后通過微生物專用數據庫比對和智能化算法分析,獲得疑似致病微生物的種屬信息,并出具全面深入的報告,這為疑難危重特殊感染的病原體檢測等應用提供了一種新方法和新平臺。


GenoCare病原微生物宏基因組測序方案

?適用人群:疑似病原微生物感染的患者。

?檢測內容:獲得待檢測樣品中疑似致病菌的種屬信息

?樣本類型:腦脊液,肺泡灌洗液,咽拭子,痰液等。

?測序平臺:GenoCare1600單分子基因測序儀

?樣本量:4~16個樣本/run

?樣本周轉時間(TAT):18~36小時


GenoCare單分子測序平臺與二代測序平臺的比較:

GenoCare病原微生物宏基因組測序試劑盒



傳統二代測序樣品制備流程:

GenoCare病原微生物宏基因組測序試劑盒


GenoCare單分子基因測序儀平臺樣品制備流程:

GenoCare病原微生物宏基因組測序試劑盒


技術優勢:

GenoCare病原微生物宏基因組測序試劑盒


病原微生物宏基因組檢測流程:

GenoCare病原微生物宏基因組測序試劑盒



真邁生物單分子平臺病原微生物檢測性能展示

模擬樣品測試:

以人源樣品,金黃色葡萄球菌,M13病毒及新冠病毒全長質粒,按照不同的添加比例進行混合,以分別檢測在不同混入比例下單分子平臺對于細菌及病毒樣品的檢測限。


數據分析:

經過數據過濾,使用5-10M clean reads進行去人源,同時在置信數據庫中比對分析。獲得樣品中存在的菌種信息及菌種豐度。


模擬樣品檢測結果解讀:

結果顯示:其中金黃色葡萄球菌(S.aureus)檢測限為十萬分之一( 10個copy );M13檢測限為百萬分之0.5( 100個copy );SARS-CoV-2檢測限為百萬分之0.6( 100個copy ),模擬樣品測序后的結果分析與理論混入比值比例一致。

GenoCare病原微生物宏基因組測序試劑盒


臨床樣品測試:

利用GenoCare1600平臺對疑似新冠病毒患者的咽拭子樣品進行處理并測序,經分析比對至新冠病毒上的reads為5894條且比對至SARS-CoV-2基因組獲得了97%的覆蓋率,且平均覆蓋深度為328×。

GenoCare病原微生物宏基因組測序試劑盒


* 本產品僅供研究目的使用。

相關推薦